Splice site analysis HELP

Donor side

Chr
Number of samples
Exon region
Intron region
1
23094
 A 27 C 26 C 33 A 54 G 74 G 99 T 99 A 55 A 47 G 58 T 41 T 31 T 31 T 32 T 32 T 32 T 33 T 32 T 32 T 32 T 31 T 33 T 33 T 32 T 32
2
15246
 A 28 A 27 A 34 A 60 G 76 G 99 T 98 A 60 A 48 G 56 T 44 T 33 T 34 T 35 T 35 T 35 T 36 T 35 T 35 T 34 T 35 T 36 T 36 T 36 T 36
3
4200
 A 29 A 28 A 33 A 60 G 77 G 99 T 99 A 59 A 47 G 54 T 42 T 31 T 33 T 32 T 34 T 34 T 34 T 32 T 34 T 32 T 32 T 33 T 34 T 33 T 34
4
13301
 A 28 A 27 A 36 A 57 G 76 G 99 T 99 A 61 A 48 G 56 T 45 T 30 T 32 T 32 T 33 T 32 T 34 T 33 T 33 T 32 T 32 T 34 T 33 T 33 T 32
5
6
7
10117
 A 29 C 27 A 34 A 59 G 76 G 98 T 97 A 58 A 47 G 55 T 44 T 33 T 34 T 33 T 34 T 34 T 35 T 35 T 34 T 34 T 34 T 35 T 36 T 36 T 36
8
9401
 A 29 A 27 A 33 A 57 G 76 G 99 T 98 A 58 A 47 G 56 T 43 T 32 T 32 T 33 T 35 T 34 T 35 T 34 T 34 T 34 T 33 T 34 T 34 T 34 T 35
9
5548
 T 27 A 27 A 33 A 57 G 75 G 99 T 98 A 57 A 46 G 55 T 44 T 31 T 33 T 32 T 33 T 34 T 34 T 33 T 34 T 32 T 34 T 34 T 33 T 35 T 34
10
9232
 A 28 A 26 A 34 A 55 G 74 G 10 T 99 A 57 A 47 G 53 T 42 T 30 T 33 T 31 T 32 T 31 T 32 T 32 T 32 T 31 T 31 T 32 T 31 T 33 T 32
11
12

Acceptor side

ChrNumber of samples
Intron region
Exon region
1
23094
 T 37 T 38 T 38 T 40 T 40 T 41 T 42 T 43 T 43 T 43 T 41 T 41 T 42 T 42 T 43 T 55 G 37 C 64 A 99 G 99 G 46 T 37 T 28 G 26 A 27
2
15246
 T 39 T 41 T 41 T 42 T 43 T 44 T 44 T 46 T 46 T 45 T 43 T 44 T 44 T 45 T 45 T 62 G 43 C 72 A 99 G 99 G 52 T 39 T 29 G 27 T 29
3
4200
 T 38 T 40 T 40 T 42 T 42 T 43 T 44 T 45 T 44 T 45 T 41 T 42 T 43 T 43 T 41 T 58 G 43 C 68 A 10 G 99 G 51 T 39 T 28 G 27 T 30
4
13301
 T 39 T 40 T 41 T 42 T 44 T 42 T 46 T 44 T 44 T 44 T 42 T 43 T 43 T 44 T 44 T 61 G 40 C 65 A 10 G 99 G 49 T 39 T 29 G 26 T 29
5
6
7
10117
 T 39 T 41 T 41 T 43 T 42 T 44 T 45 T 46 T 46 T 45 T 43 T 43 T 44 T 45 T 45 T 60 G 42 C 69 A 98 G 98 G 51 T 39 T 29 G 26 T 28
8
9401
 T 40 T 40 T 40 T 42 T 42 T 43 T 43 T 44 T 45 T 44 T 42 T 43 T 43 T 44 T 45 T 60 G 42 C 69 A 99 G 99 G 51 T 38 T 29 G 27 T 27
9
5548
 T 39 T 40 T 40 T 42 T 42 T 42 T 45 T 43 T 45 T 42 T 42 T 42 T 44 T 45 T 44 T 61 G 42 C 67 A 99 G 99 G 51 T 38 T 28 G 26 T 27
10
9232
 T 37 T 38 T 39 T 41 T 40 T 41 T 43 T 43 T 43 T 42 T 42 T 41 T 42 T 43 T 43 T 58 G 40 C 62 A 10 G 99 G 48 T 37 T 27 G 27 T 29
11
12